Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF728P0DKX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF728P0DKX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF728P0DKX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF728P0DKX0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms