Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT1P04264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT1P04264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT1P04264 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT1P04264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT1P04264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT1P04264 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT1P04264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT1P04264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT1P04264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT1P04264 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT1P04264 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT1P04264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT1P04264 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT1P04264 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT1P04264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT1P04264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT1P04264 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT1P04264 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT1P04264 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT1P04264 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT1P04264 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT1P04264 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT1P04264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT1P04264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT1P04264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT1P04264 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT1P04264 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT1P04264 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT1P04264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT1P04264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT1P04264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT1P04264 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT1P04264 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT1P04264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT1P04264 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT1P04264 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT1P04264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT1P04264 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT1P04264 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT1P04264 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT1P04264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT1P04264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT1P04264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT1P04264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT1P04264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT1P04264 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT1P04264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT1P04264 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT1P04264 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT1P04264 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT1P04264 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT1P04264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT1P04264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT1P04264 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT1P04264 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT1P04264 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT1P04264 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT1P04264 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT1P04264 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT1P04264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT1P04264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT1P04264 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT1P04264 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT1P04264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT1P04264 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT1P04264 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT1P04264 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT1P04264 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT1P04264 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT1P04264 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT1P04264 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT1P04264 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT1P04264 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT1P04264 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT1P04264 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT1P04264 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT1P04264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT1P04264 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT1P04264 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT1P04264 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT1P04264 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT1P04264 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT1P04264 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT1P04264 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT1P04264 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT1P04264 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT1P04264 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT1P04264 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT1P04264 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT1P04264 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT1P04264 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT1P04264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT1P04264 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms