Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF12O95522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF12O95522 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRAMEF12O95522 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF12O95522 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms