Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SEC24BO95487 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SEC24BO95487 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEC24BO95487 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEC24BO95487 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEC24BO95487 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEC24BO95487 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms