Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF6BO95407 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF6BO95407 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF6BO95407 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF6BO95407 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF6BO95407 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms