Protein–RNA interactions for Protein: O75751

SLC22A3, Solute carrier family 22 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A3O75751 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A3O75751 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A3O75751 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A3O75751 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC22A3O75751 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC22A3O75751 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A3O75751 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A3O75751 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms