Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG13O75143 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG13O75143 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG13O75143 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG13O75143 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG13O75143 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG13O75143 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG13O75143 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG13O75143 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG13O75143 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATG13O75143 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG13O75143 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG13O75143 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG13O75143 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG13O75143 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG13O75143 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG13O75143 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG13O75143 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG13O75143 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG13O75143 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG13O75143 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG13O75143 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG13O75143 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG13O75143 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG13O75143 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG13O75143 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG13O75143 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG13O75143 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG13O75143 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG13O75143 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG13O75143 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG13O75143 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG13O75143 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG13O75143 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG13O75143 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG13O75143 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG13O75143 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG13O75143 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG13O75143 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG13O75143 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG13O75143 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG13O75143 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG13O75143 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG13O75143 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG13O75143 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG13O75143 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG13O75143 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG13O75143 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG13O75143 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG13O75143 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG13O75143 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG13O75143 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG13O75143 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG13O75143 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG13O75143 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG13O75143 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG13O75143 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG13O75143 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG13O75143 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG13O75143 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG13O75143 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG13O75143 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms