Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COBLO75128 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COBLO75128 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COBLO75128 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COBLO75128 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COBLO75128 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
COBLO75128 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
COBLO75128 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COBLO75128 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COBLO75128 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COBLO75128 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COBLO75128 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COBLO75128 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COBLO75128 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COBLO75128 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COBLO75128 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COBLO75128 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COBLO75128 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COBLO75128 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COBLO75128 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COBLO75128 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COBLO75128 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COBLO75128 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COBLO75128 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
COBLO75128 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
COBLO75128 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COBLO75128 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
COBLO75128 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COBLO75128 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COBLO75128 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COBLO75128 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COBLO75128 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COBLO75128 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COBLO75128 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COBLO75128 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COBLO75128 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COBLO75128 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COBLO75128 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COBLO75128 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COBLO75128 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COBLO75128 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COBLO75128 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COBLO75128 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COBLO75128 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COBLO75128 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COBLO75128 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COBLO75128 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COBLO75128 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COBLO75128 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COBLO75128 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COBLO75128 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
COBLO75128 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COBLO75128 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COBLO75128 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COBLO75128 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COBLO75128 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COBLO75128 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
COBLO75128 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COBLO75128 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COBLO75128 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COBLO75128 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COBLO75128 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COBLO75128 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COBLO75128 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COBLO75128 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COBLO75128 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COBLO75128 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COBLO75128 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COBLO75128 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COBLO75128 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COBLO75128 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COBLO75128 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COBLO75128 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COBLO75128 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
COBLO75128 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COBLO75128 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COBLO75128 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COBLO75128 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
COBLO75128 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COBLO75128 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COBLO75128 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms