Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM9SF1O15321 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM9SF1O15321 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM9SF1O15321 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM9SF1O15321 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TM9SF1O15321 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms