Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CAPN9O14815 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN9O14815 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN9O14815 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN9O14815 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN9O14815 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN9O14815 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN9O14815 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN9O14815 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN9O14815 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN9O14815 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN9O14815 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN9O14815 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN9O14815 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAPN9O14815 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN9O14815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN9O14815 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN9O14815 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CAPN9O14815 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms