Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms