Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00587B1AMM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00587B1AMM8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00587B1AMM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms