Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR3A8MPY1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR3A8MPY1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR3A8MPY1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRR3A8MPY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRR3A8MPY1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377 ms