Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPK0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PPK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms