Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-5A0A0J9YX44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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