Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A087X0B3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087X0B3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A087X0B3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087X0B3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087X0B3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A087X0B3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A087X0B3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A087X0B3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A087X0B3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms