Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms