Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME3Q16798 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME3Q16798 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME3Q16798 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME3Q16798 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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