Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 NBL1YHR199C-A 222 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 RGM1YMR182C 636 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YPL238CYPL238C 390 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 RTG3YBL103C 1461 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 APC2YLR127C 2562 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 COG1YGL223C 1254 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 DYN3YMR299C 939 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 PIN3YPR154W 648 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 SHS1YDL225W 1656 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 RRP6YOR001W 2202 nt0.79□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 HUL5YGL141W 2733 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 PBP4YDL053C 558 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YLR379WYLR379W 375 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YMR144WYMR144W 1029 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 HSH49YOR319W 642 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 ISA2YPR067W 558 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 MRP2YPR166C 348 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 DAL5YJR152W 1632 nt0.78□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 MSS2YDL107W 1056 nt0.78□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 RPL37BYDR500C 267 nt0.78□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 ACB1YGR037C 264 nt0.78□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 HHT2YNL031C 411 nt0.78□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 YRO2YBR054W 1035 nt0.78□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 UBC5YDR059C 447 nt0.77□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 YNR066CYNR066C 1311 nt0.77□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 ESA1YOR244W 1338 nt0.77□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 COS7YDL248W 1152 nt0.76□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 BST1YFL025C 3090 nt0.76□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 MPD1YOR288C 957 nt0.75□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 MSS4YDR208W 2340 nt0.75□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 BEM3YPL115C 3387 nt0.75□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 YDR018CYDR018C 1191 nt0.75□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 CTK3YML112W 891 nt0.74□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 ALY2YJL084C 3141 nt0.74□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 LST4YKL176C 2487 nt0.73□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 CDC27YBL084C 2277 nt0.73□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 BAG7YOR134W 1230 nt0.73□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 SRL1YOR247W 633 nt0.73□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 EST2YLR318W 2655 nt0.72□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 SHR3YDL212W 633 nt0.72□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 ATG5YPL149W 885 nt0.72□□□□□ -2.29
TY2B-DR1Q12472 FUS1YCL027W 1539 nt0.71□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 PPN1YDR452W 2025 nt0.71□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.71□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 RGI2YIL057C 495 nt0.71□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 AEP3YPL005W 1821 nt0.71□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 CDC50YCR094W 1176 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 PEX27YOR193W 1131 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 HSE1YHL002W 1359 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 SLF1YDR515W 1344 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YAR075WYAR075W 474 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 SHE3YBR130C 1278 nt0.7□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YDL026WYDL026W 312 nt0.69□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 MED11YMR112C 396 nt0.69□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YBR032WYBR032W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 ASI3YNL008C 2031 nt0.69□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 ATP16YDL004W 483 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 BTT1YDR252W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 MMF1YIL051C 438 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YLR169WYLR169W 354 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 snR14snR14 160 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YPL035CYPL035C 348 nt0.68□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 MON1YGL124C 1935 nt0.67□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 AIM6YDL237W 1173 nt0.67□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YLR149CYLR149C 2193 nt0.67□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 SEC63YOR254C 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 MNE1YOR350C 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 SRN2YLR119W 642 nt0.66□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 HMI1YOL095C 2121 nt0.66□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 SHU2YDR078C 672 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 HLR1YDR528W 1272 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 CKA1YIL035C 1119 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YLR400WYLR400W 474 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 YBR277CYBR277C 402 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 TRM12YML005W 1389 nt0.65□□□□□ -2.3
TY2B-DR1Q12472 BIT61YJL058C 1632 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 RLM1YPL089C 2031 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 LRS4YDR439W 1044 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YMR31YFR049W 372 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CIC1YHR052W 1131 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YLR444CYLR444C 303 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CPR3YML078W 549 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CAF20YOR276W 486 nt0.65□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 KAP122YGL016W 3246 nt0.64□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YDR355CYDR355C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CTR9YOL145C 3234 nt0.64□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 PAF1YBR279W 1338 nt0.64□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 GLC7YER133W 939 nt0.63□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YBL029WYBL029W 1131 nt0.63□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 PRK1YIL095W 2433 nt0.63□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YNL034WYNL034W 1839 nt0.63□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 PUS9YDL036C 1389 nt0.63□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 TOA1YOR194C 861 nt0.62□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 SPO74YGL170C 1242 nt0.62□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 NYV1YLR093C 762 nt0.62□□□□□ -2.31
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