Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	YOL114C	YOL114C	609 nt		0.75	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	snR11	snR11	258 nt		0.75	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	MPD1	YOR288C	957 nt		0.75	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	MLH3	YPL164C	2148 nt		0.75	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	APD1	YBR151W	951 nt		0.75	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YGR290W	YGR290W	444 nt		0.74	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	OMA1	YKR087C	1038 nt		0.74	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	SRL1	YOR247W	633 nt		0.74	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YDL026W	YDL026W	312 nt		0.73	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		0.73	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		0.72	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YLR379W	YLR379W	375 nt		0.72	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	TRM2	YKR056W	1920 nt		0.72	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	CTK3	YML112W	891 nt		0.72	□□□□□ -2.29
SMC4	Q12267	YOR343W-B	YOR343W-B	5313 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	WAR1	YML076C	2835 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	SEC59	YMR013C	1560 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	COS7	YDL248W	1152 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	ACB1	YGR037C	264 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	RRT7	YLL030C	342 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	ERD2	YBL040C	660 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	DYN3	YMR299C	939 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	STE24	YJR117W	1362 nt		0.71	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	RPL37B	YDR500C	267 nt		0.7	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	CIC1	YHR052W	1131 nt		0.7	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YMR031W-A	YMR031W-A	327 nt		0.7	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		0.69	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	MRP2	YPR166C	348 nt		0.69	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YLL054C	YLL054C	2532 nt		0.69	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	UBC5	YDR059C	447 nt		0.68	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YBL028C	YBL028C	321 nt		0.68	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YNR066C	YNR066C	1311 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YGL177W	YGL177W	348 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	RNP1	YLL046C	750 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YAR075W	YAR075W	474 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	RRP6	YOR001W	2202 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YDR132C	YDR132C	1488 nt		0.67	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YJR029W	YJR029W	5268 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YPR137C-B	YPR137C-B	5268 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YCR007C	YCR007C	720 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YGR026W	YGR026W	837 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YHR145C	YHR145C	357 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	FIP1	YJR093C	984 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	ASI3	YNL008C	2031 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	RTG3	YBL103C	1461 nt		0.66	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YHR214W-A	YHR214W-A	486 nt		0.65	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	YAR068W	YAR068W	486 nt		0.65	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	LTP1	YPR073C	486 nt		0.65	□□□□□ -2.3
SMC4	Q12267	SLK19	YOR195W	2466 nt		0.65	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	snR76	snR76	109 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YEL075C	YEL075C	369 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	CPR3	YML078W	549 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YBR032W	YBR032W	303 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	DAL5	YJR152W	1632 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	KAP122	YGL016W	3246 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SNX4	YJL036W	1272 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	RGM1	YMR182C	636 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YNL179C	YNL179C	438 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YRO2	YBR054W	1035 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	MRPL40	YPL173W	894 nt		0.64	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	DXO1	YDR370C	1329 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	UBC9	YDL064W	474 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	MSS2	YDL107W	1056 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	BNA7	YDR428C	786 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YLR053C	YLR053C	327 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	MUK1	YPL070W	1839 nt		0.63	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	APC2	YLR127C	2562 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	HMI1	YOL095C	2121 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YIP1	YGR172C	747 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YTH1	YPR107C	627 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YBR277C	YBR277C	402 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	HUL5	YGL141W	2733 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SGD1	YLR336C	2700 nt		0.62	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SLF1	YDR515W	1344 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SPO74	YGL170C	1242 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	RPL40A	YIL148W	387 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	RSM26	YJR101W	801 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YMR147W	YMR147W	672 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	HSH49	YOR319W	642 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SHE3	YBR130C	1278 nt		0.61	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SAS3	YBL052C	2496 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	SHR3	YDL212W	633 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YLR169W	YLR169W	354 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	YMR144W	YMR144W	1029 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	CUR1	YPR158W	759 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	RXT2	YBR095C	1293 nt		0.6	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	CTR9	YOL145C	3234 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	BTT1	YDR252W	450 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	COG1	YGL223C	1254 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	TIM21	YGR033C	720 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	PRS3	YHL011C	963 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	ISA2	YPR067W	558 nt		0.59	□□□□□ -2.31
SMC4	Q12267	RPL9A	YGL147C	576 nt		0.58	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	RGI2	YIL057C	495 nt		0.58	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	YBL029W	YBL029W	1131 nt		0.58	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	YNL143C	YNL143C	393 nt		0.58	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	YNL034W	YNL034W	1839 nt		0.58	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	CDC50	YCR094W	1176 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	SNC2	YOR327C	348 nt		0.57	□□□□□ -2.32

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