Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	JID1	YPR061C	906 nt		2.58	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	SHE9	YDR393W	1371 nt		2.58	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	ECM5	YMR176W	4236 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	PRM8	YGL053W	714 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	VPS51	YKR020W	495 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	ARV1	YLR242C	966 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	ICY1	YMR195W	384 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	CRS5	YOR031W	210 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	SEC16	YPL085W	6588 nt		2.57	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	CLN3	YAL040C	1743 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YNL034W	YNL034W	1839 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	PHO80	YOL001W	882 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	DGK1	YOR311C	873 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YPL080C	YPL080C	327 nt		2.56	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	MTC7	YEL033W	420 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	EAF6	YJR082C	342 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	INP53	YOR109W	3324 nt		2.55	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	GCN4	YEL009C	846 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	RNP1	YLL046C	750 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YHC1	YLR298C	696 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YCL023C	YCL023C	348 nt		2.54	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	TOF1	YNL273W	3717 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	RTR2	YDR066C	591 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	SWM2	YNR004W	441 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.53	□□□□□ -2
MRD1	Q06106	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.53	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	ECM25	YJL201W	1800 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TFC3	YAL001C	3483 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	VPH2	YKL119C	648 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TOA1	YOR194C	861 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TRM7	YBR061C	933 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	UTP22	YGR090W	3714 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SSQ1	YLR369W	1974 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TRS130	YMR218C	3309 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SNU56	YDR240C	1479 nt		2.52	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PHR1	YOR386W	1698 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	GPI8	YDR331W	1236 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PEX4	YGR133W	552 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	LAG1	YHL003C	1236 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YJL202C	YJL202C	348 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YKL165C-A	YKL165C-A	234 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	ATP19	YOL077W-A	207 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPL25	YOL127W	429 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PET123	YOR158W	957 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YPL039W	YPL039W	951 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SVS1	YPL163C	783 nt		2.51	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PUT3	YKL015W	2940 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	BRP1	YGL007W	378 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPF1	YHR088W	888 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SPC1	YJR010C-A	285 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PEX17	YNL214W	600 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RSA1	YPL193W	1146 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	DAD3	YBR233W-A	285 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	ALK2	YBL009W	2031 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	UBP1	YDL122W	2430 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	NDD1	YOR372C	1665 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	BNI1	YNL271C	5862 nt		2.5	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	AHC2	YCR082W	387 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YDR199W	YDR199W	366 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	IRC4	YDR540C	540 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	FYV7	YLR068W	456 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	HOS4	YIL112W	3252 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PES4	YFR023W	1836 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SSD1	YDR293C	3753 nt		2.49	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YJL181W	YJL181W	1836 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YDR220C	YDR220C	294 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YGR050C	YGR050C	357 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	TIM10	YHR005C-A	282 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YIL058W	YIL058W	285 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YJR023C	YJR023C	402 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YKL044W	YKL044W	321 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	MRPL44	YMR225C	297 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YNL122C	YNL122C	348 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.48	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	DPB11	YJL090C	2295 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RVS161	YCR009C	798 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPL9A	YGL147C	576 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	YHR180W-A	YHR180W-A	183 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	RPL37A	YLR185W	267 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	HRD3	YLR207W	2502 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	UTP13	YLR222C	2454 nt		2.47	□□□□□ -2.01
MRD1	Q06106	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.47	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms