Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 YCR001WYCR001W 315 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 ERV1YGR029W 570 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RPL16AYIL133C 600 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YKL044WYKL044W 321 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SIP18YMR175W 240 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YNR021WYNR021W 1215 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 PEP12YOR036W 867 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SNF12YNR023W 1701 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 NPR1YNL183C 2373 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SPP41YDR464W 4308 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 TRM2YKR056W 1920 nt2.6□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.6□□□□□ -1.99
HEF3P53978 MXR1YER042W 555 nt2.6□□□□□ -1.99
HEF3P53978 APC2YLR127C 2562 nt2.6□□□□□ -1.99
HEF3P53978 POM152YMR129W 4014 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 NEO1YIL048W 3456 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 FIR1YER032W 2631 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 EMP24YGL200C 612 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 ARV1YLR242C 966 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 LSM2YBL026W 288 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 GPI15YNL038W 690 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 ATX2YOR079C 942 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RSA1YPL193W 1146 nt2.59□□□□□ -1.99
HEF3P53978 UBP16YPL072W 1500 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 YHC1YLR298C 696 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 MRPL33YMR286W 261 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 SPC29YPL124W 762 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 DUG2YBR281C 2637 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 TRS130YMR218C 3309 nt2.58□□□□□ -2
HEF3P53978 RLF2YPR018W 1821 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 RTR2YDR066C 591 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 TIF35YDR429C 825 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 RAD6YGL058W 519 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 YLR379WYLR379W 375 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 PBI2YNL015W 228 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 YNL046WYNL046W 519 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 ESF2YNR054C 951 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 ARR2YPR200C 393 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 YCL023CYCL023C 348 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 SWR1YDR334W 4545 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 BRE1YDL074C 2103 nt2.57□□□□□ -2
HEF3P53978 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 RPS17BYDR447C 411 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 RPL29YFR032C-A 180 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 YAP3YHL009C 993 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 FYV4YHR059W 393 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 RUF22RUF22 515 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 NSL1YPL233W 651 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 UBP2YOR124C 3819 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 TOP2YNL088W 4287 nt2.56□□□□□ -2
HEF3P53978 RRP12YPL012W 3687 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 PEP1YBL017C 4740 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 GIS1YDR096W 2685 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 YHR130CYHR130C 336 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 YJL007CYJL007C 315 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 SPC1YJR010C-A 285 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 SGM1YJR134C 2124 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 MSS18YPR134W 807 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 GYP5YPL249C 2685 nt2.55□□□□□ -2
HEF3P53978 COX13YGL191W 390 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 RTS3YGR161C 792 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 YJR157WYJR157W 363 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 YPL080CYPL080C 327 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 YPL205CYPL205C 345 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 ACM1YPL267W 630 nt2.54□□□□□ -2
HEF3P53978 BNA7YDR428C 786 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 TSA2YDR453C 591 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 SYM1YLR251W 594 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 CTK3YML112W 891 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 SWM2YNR004W 441 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 COQ10YOL008W 624 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 RLI1YDR091C 1827 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 SEC16YPL085W 6588 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 AMS1YGL156W 3252 nt2.53□□□□□ -2
HEF3P53978 PUF4YGL014W 2667 nt2.53□□□□□ -2.01
HEF3P53978 ASM4YDL088C 1587 nt2.53□□□□□ -2.01
HEF3P53978 KAP123YER110C 3342 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 PSK2YOL045W 3306 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 RPL27BYDR471W 411 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YPL039WYPL039W 951 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YIL166CYIL166C 1629 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 GCV2YMR189W 3105 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YNL034WYNL034W 1839 nt2.52□□□□□ -2.01
HEF3P53978 UTP13YLR222C 2454 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 NPR3YHL023C 3441 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 ADK1YDR226W 669 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 GPI19YDR437W 423 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YER189WYER189W 369 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YLR171WYLR171W 390 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 DDR48YMR173W 1293 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 LEU3YLR451W 2661 nt2.51□□□□□ -2.01
HEF3P53978 BI2Q0110 1272 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.5□□□□□ -2.01
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