Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms