Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YRO2YBR054W 1035 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 PIN3YPR154W 648 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 MED8YBR193C 672 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 PUF4YGL014W 2667 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 MFB1YDR219C 1398 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 FIP1YJR093C 984 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 YBL077WYBL077W 432 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 YDR338CYDR338C 2088 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 GLC7YER133W 939 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 SPO12YHR152W 522 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 YIL082WYIL082W 873 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 YOR203WYOR203W 354 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 YCS4YLR272C 3531 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 TBS1YBR150C 3285 nt0.96□□□□□ -2.25
YRF1-8P0CX22 SPO77YLR341W 1434 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 SRP1YNL189W 1629 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YMR31YFR049W 372 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 CKA1YIL035C 1119 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 CLB5YPR120C 1308 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 BIT61YJL058C 1632 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 ACB1YGR037C 264 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 HRT3YLR097C 1035 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YNR066CYNR066C 1311 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 APC5YOR249C 2058 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 RKR1YMR247C 4689 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 RSA3YLR221C 663 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 VTI1YMR197C 654 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 WAR1YML076C 2835 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YGR290WYGR290W 444 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 SNC1YAL030W 354 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 MSA2YKR077W 1092 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 RPL31AYDL075W 342 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 RPL37BYDR500C 267 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 RGI2YIL057C 495 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 UBX4YMR067C 1251 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 BAG7YOR134W 1230 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 ATG5YPL149W 885 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 HLR1YDR528W 1272 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 NYV1YLR093C 762 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YPL238CYPL238C 390 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 BEM3YPL115C 3387 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 CRD1YDL142C 852 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 LTP1YPR073C 486 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 MNL2YLR057W 2550 nt0.9□□□□□ -2.26
YRF1-8P0CX22 PBP4YDL053C 558 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 RMD5YDR255C 1266 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YJL169WYJL169W 369 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 MRP49YKL167C 414 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YMR181CYMR181C 465 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 LTO1YNL260C 597 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 PRM4YPL156C 855 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 PRK1YIL095W 2433 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 FUS1YCL027W 1539 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 PPN1YDR452W 2025 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YLR140WYLR140W 327 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 CTL1YMR180C 963 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 ARK1YNL020C 1917 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 ATG10YLL042C 504 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YLR290CYLR290C 834 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 GCD2YGR083C 1956 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 STB4YMR019W 2850 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 SHR3YDL212W 633 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YER189WYER189W 369 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YGL242CYGL242C 546 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 MTG1YMR097C 1104 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 PEX27YOR193W 1131 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 COG8YML071C 1824 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 SLF1YDR515W 1344 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 MLH3YPL164C 2148 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 AIM6YDL237W 1173 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 UBC5YDR059C 447 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 RPA12YJR063W 378 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YBR277CYBR277C 402 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 MNE1YOR350C 1992 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 FSH1YHR049W 732 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 SRN2YLR119W 642 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YMR099CYMR099C 894 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 PFK27YOL136C 1194 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 SPC29YPL124W 762 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YJR029WYJR029W 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 BTT1YDR252W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 EPT1YHR123W 1176 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-8P0CX22 HIR3YJR140C 4947 nt0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms