Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms