Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP3Q6Q6R5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms