Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 HAA1YPR008W 2085 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 YDR018CYDR018C 1191 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 RPL14BYHL001W 417 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 PRS3YHL011C 963 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 RIO2YNL207W 1278 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 RPL25YOL127W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 SWR1YDR334W 4545 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 VPS16YPL045W 2397 nt2.72□□□□□ -1.97
RTP1Q12751 GAL80YML051W 1308 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PDR11YIL013C 4236 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 TRA1YHR099W 11235 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 snR9snR9 187 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 IRC2YDR112W 309 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YDR199WYDR199W 366 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YDR537CYDR537C 606 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 VTC1YER072W 390 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YGL042CYGL042C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 TAP42YMR028W 1101 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 MUD1YBR119W 897 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 ECM5YMR176W 4236 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 INP53YOR109W 3324 nt2.71□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 RRP12YPL012W 3687 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 NCB2YDR397C 441 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 EMC4YGL231C 573 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 BET3YKR068C 582 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YLR302CYLR302C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 GMC2YLR445W 567 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 ATP18YML081C-A 180 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 CSM4YPL200W 471 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SRO77YBL106C 3033 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PES4YFR023W 1836 nt2.7□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PHO2YDL106C 1680 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YDR029WYDR029W 315 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PET191YJR034W 327 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 HHT2YNL031C 411 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 KTI11YBL071W-A 249 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 LOA1YPR139C 903 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 CBF2YGR140W 2871 nt2.69□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 RGL1YPL066W 1440 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 GIS1YDR096W 2685 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 APL5YPL195W 2799 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 ECM25YJL201W 1800 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PDR1YGL013C 3207 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 OCA6YDR067C 675 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SDC1YDR469W 528 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 TMA20YER007C-A 546 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YGL165CYGL165C 579 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 VMA21YGR105W 234 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YJR087WYJR087W 351 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PAU8YAL068C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 PAU20YOL161C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YOR364WYOR364W 369 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SSF2YDR312W 1362 nt2.68□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YEL043WYEL043W 2871 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YKR078WYKR078W 1758 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YDL009CYDL009C 324 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YRB1YDR002W 606 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 TIM9YEL020W-A 264 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 BUD19YJL188C 309 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YBR277CYBR277C 402 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YCL023CYCL023C 348 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 NUP100YKL068W 2880 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 RRI2YOL117W 1938 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 TRS130YMR218C 3309 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SSE1YPL106C 2082 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 GIN4YDR507C 3429 nt2.67□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SLX9YGR081C 633 nt2.66□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YGR293CYGR293C 462 nt2.66□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 HRI1YLR301W 735 nt2.66□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 ATG11YPR049C 3537 nt2.66□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 YJL070CYJL070C 2667 nt2.65□□□□□ -1.98
RTP1Q12751 SAK1YER129W 3429 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 GPI8YDR331W 1236 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 TSA2YDR453C 591 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 AAD16YFL057C 459 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YGR228WYGR228W 345 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 APQ13YJL075C 417 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 CSE4YKL049C 690 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YLR255CYLR255C 354 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 IGO1YNL157W 507 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YPL068CYPL068C 882 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YBR071WYBR071W 636 nt2.65□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 CSF1YLR087C 8877 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RAV1YJR033C 4074 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 ASG1YIL130W 2895 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 SSQ1YLR369W 1974 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 COG2YGR120C 789 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 DFG10YIL049W 762 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 VPS51YKR020W 495 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 LSM2YBL026W 288 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 ARF3YOR094W 552 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 ALG14YBR070C 714 nt2.64□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RBL2YOR265W 321 nt2.63□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YPR172WYPR172W 603 nt2.63□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 UBR1YGR184C 5853 nt2.63□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 TMN3YER113C 2121 nt2.63□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.63□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YFH1YDL120W 525 nt2.62□□□□□ -1.99
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