Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 GPI8YDR331W 1236 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 LSM8YJR022W 330 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 YKL111CYKL111C 336 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 NDT80YHR124W 1884 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 RRP5YMR229C 5190 nt3.66□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 STT4YLR305C 5703 nt3.65□□□□□ -1.82
RKM4Q12504 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YGR107WYGR107W 450 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 COX23YHR116W 456 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 ISU1YPL135W 498 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 SET1YHR119W 3243 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 JIP5YPR169W 1479 nt3.65□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 MNT3YIL014W 1893 nt3.64□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 VBA4YDR119W 2307 nt3.64□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 MRH1YDR033W 963 nt3.64□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 CHS3YBR023C 3498 nt3.64□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YSW1YBR148W 1830 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 PSF1YDR013W 627 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YDR102CYDR102C 333 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 TSA2YDR453C 591 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 RPS28BYLR264W 204 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 TIM18YOR297C 579 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YAK1YJL141C 2424 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 NMA111YNL123W 2994 nt3.63□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 SNX41YDR425W 1878 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YLR352WYLR352W 2424 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YLR012CYLR012C 300 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 GOT1YMR292W 417 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 BIL1YOR304C-A 231 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 CCT7YJL111W 1653 nt3.62□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YHR080CYHR080C 4038 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 HMRA2YCR096C 360 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 snR8snR8 190 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YAR029WYAR029W 225 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 OST1YJL002C 1431 nt3.61□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 BIT61YJL058C 1632 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YFL032WYFL032W 321 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YFL065CYFL065C 309 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 SHH3YMR118C 591 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YPL238CYPL238C 390 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 YPR014CYPR014C 330 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 ROX1YPR065W 1107 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 DNM1YLL001W 2274 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 SNT1YCR033W 3681 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 REC8YPR007C 2043 nt3.6□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 REG1YDR028C 3045 nt3.59□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 COA4YLR218C 453 nt3.59□□□□□ -1.83
RKM4Q12504 PDC2YDR081C 2778 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 SPA2YLL021W 4401 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 BAT1YHR208W 1182 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 ANB1YJR047C 474 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 PRE8YML092C 753 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 NOP4YPL043W 2058 nt3.58□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 MSH2YOL090W 2895 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 HPA3YEL066W 540 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YJL202CYJL202C 348 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 NDD1YOR372C 1665 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 EGD1YPL037C 474 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 snR191snR191 274 nt3.57□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 TFB1YDR311W 1929 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 CDH1YGL003C 1701 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 AAD16YFL057C 459 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 URM1YIL008W 300 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 MSL1YIR009W 336 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 TIM8YJR135W-A 264 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 RPS7AYOR096W 573 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 snR36snR36 182 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YTA7YGR270W 4140 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 CIN8YEL061C 3003 nt3.56□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 ENA2YDR039C 3276 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 ENA1YDR040C 3276 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 MBB1YJL199C 327 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 MCM22YJR135C 720 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 TCP1YDR212W 1680 nt3.55□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 RPS23AYGR118W 438 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 RPS22BYLR367W 393 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 SSN8YNL025C 972 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 AUS1YOR011W 4185 nt3.54□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 MTR4YJL050W 3222 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 STE5YDR103W 2754 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 SKP2YNL311C 2292 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 YEL057CYEL057C 702 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 PAU14YIL176C 363 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 RPL39YJL189W 156 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 PAU1YJL223C 363 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 AIM32YML050W 936 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 SWD3YBR175W 948 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 STU2YLR045C 2667 nt3.53□□□□□ -1.84
RKM4Q12504 GCN1YGL195W 8019 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 VPS3YDR495C 3036 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 ROM1YGR070W 3468 nt3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 189.2 ms