Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 AFI1YOR129C 2682 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YDR250CYDR250C 276 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YHR054CYHR054C 1065 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 VPS63YLR261C 327 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YOR169CYOR169C 465 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 RCN2YOR220W 798 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CSM4YPL200W 471 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YPR172WYPR172W 603 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SLN1YIL147C 3663 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 RAV1YJR033C 4074 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YEL043WYEL043W 2871 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YDR338CYDR338C 2088 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YCL020WYCL020W 1317 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 IRC8YJL051W 2469 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SDC1YDR469W 528 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 ATG38YLR211C 681 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SWS2YNL081C 432 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SSP1YHR184W 1716 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 KSP1YHR082C 3090 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 ADK1YDR226W 669 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 GPI19YDR437W 423 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YGR242WYGR242W 309 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YJL086CYJL086C 369 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 VPS51YKR020W 495 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PAU8YAL068C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 ATP18YML081C-A 180 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 RIO2YNL207W 1278 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SWM2YNR004W 441 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PAU20YOL161C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 MEI5YPL121C 669 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 LOA1YPR139C 903 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 VMA9YCL005W-A 222 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 NUP170YBL079W 4509 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CBF2YGR140W 2871 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 GAL80YML051W 1308 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SAP185YJL098W 3177 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 AHC2YCR082W 387 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CRD1YDL142C 852 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YDL187CYDL187C 330 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 VTC1YER072W 390 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 GLC7YER133W 939 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YGL042CYGL042C 306 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 EMC4YGL231C 573 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SCEIQ0160 708 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YIL082WYIL082W 873 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 GMC2YLR445W 567 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CSI1YMR025W 888 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YNL150WYNL150W 408 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PEP12YOR036W 867 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 BNI1YNL271C 5862 nt2.22□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YJL181WYJL181W 1836 nt2.21□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SHE4YOR035C 2370 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SAP190YKR028W 3102 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 GCN4YEL009C 846 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RPS24AYER074W 408 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 VMA21YGR105W 234 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YGR228WYGR228W 345 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 FYV4YHR059W 393 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 STE18YJR086W 333 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 TMA10YLR327C 261 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 VID24YBR105C 1089 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YRR1YOR162C 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 UBP16YPL072W 1500 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YKL075CYKL075C 1353 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 TRZ1YKR079C 2517 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YIL166CYIL166C 1629 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SNU114YKL173W 3027 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 IRC2YDR112W 309 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YDR199WYDR199W 366 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 ACB1YGR037C 264 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 AYR1YIL124W 894 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 BET4YJL031C 984 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 CSE4YKL049C 690 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SSE1YPL106C 2082 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YPR089WYPR089W 2667 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 UBR1YGR184C 5853 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 GIP3YPL137C 3831 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YDR537CYDR537C 606 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SLX9YGR081C 633 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RPS17AYML024W 411 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SSD1YDR293C 3753 nt2.19□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 UTP22YGR090W 3714 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 VPS74YDR372C 1038 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 ATP7YKL016C 525 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RLP24YLR009W 600 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 TAP42YMR028W 1101 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 UBX4YMR067C 1251 nt2.18□□□□□ -2.06
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