Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms