Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 CLN3YAL040C 1743 nt2.47□□□□□ -2.01
SPC19Q03954 REV1YOR346W 2958 nt2.47□□□□□ -2.01
SPC19Q03954 UBP11YKR098C 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
SPC19Q03954 SSF1YHR066W 1362 nt2.47□□□□□ -2.01
SPC19Q03954 YHR078WYHR078W 1659 nt2.47□□□□□ -2.01
SPC19Q03954 APM3YBR288C 1452 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 FMP16YDR070C 282 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 AIM18YHR198C 966 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 IST3YIR005W 447 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 PEP8YJL053W 1140 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YOR152CYOR152C 771 nt2.46□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 USO1YDL058W 5373 nt2.45□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.45□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YOR331CYOR331C 558 nt2.45□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 NUP120YKL057C 3114 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 RRP12YPL012W 3687 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YDR018CYDR018C 1191 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 ARV1YLR242C 966 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YML037CYML037C 1023 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 LSM7YNL147W 348 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 GIP3YPL137C 3831 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 MGR1YCL044C 1254 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 RRI2YOL117W 1938 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 RGA1YOR127W 3024 nt2.44□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 RTT107YHR154W 3213 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YDL187CYDL187C 330 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 SCEIQ0160 708 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 TPM2YIL138C 486 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YAP5YIR018W 738 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 BET4YJL031C 984 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YHC1YLR298C 696 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 JIP3YLR331C 378 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 IST2YBR086C 2841 nt2.43□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YGR226CYGR226C 210 nt2.42□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 AIM19YIL087C 474 nt2.42□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 CDC53YDL132W 2448 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 RUD3YOR216C 1455 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 AHC2YCR082W 387 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 VMA21YGR105W 234 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 ATG38YLR211C 681 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 YPR147CYPR147C 915 nt2.41□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 BRO1YPL084W 2535 nt2.4□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 TOF1YNL273W 3717 nt2.4□□□□□ -2.02
SPC19Q03954 MSL1YIR009W 336 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 CCW14YLR390W-A 717 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 COX14YML129C 213 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 CAT5YOR125C 702 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 NCL1YBL024W 2055 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YJL181WYJL181W 1836 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 PDR1YGL013C 3207 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 MPH1YIR002C 2982 nt2.4□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SEC16YPL085W 6588 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 NOP10YHR072W-A 177 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SNC1YAL030W 354 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 CMS1YLR003C 876 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YOR105WYOR105W 327 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YPL080CYPL080C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 BUD2YKL092C 3315 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 VPS13YLL040C 9435 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 DPB11YJL090C 2295 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 UBP15YMR304W 3693 nt2.39□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 PTP3YER075C 2787 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YEF3YLR249W 3135 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 IPT1YDR072C 1584 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 LRP1YHR081W 555 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 MMS22YLR320W 4365 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 DNA2YHR164C 4569 nt2.38□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 TAE2YPL009C 3117 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YDR042CYDR042C 603 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SMD1YGR074W 441 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SLX9YGR081C 633 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YIR020CYIR020C 303 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 TOA1YOR194C 861 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YOR333CYOR333C 417 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YPR096CYPR096C 303 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SPO22YIL073C 2928 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 AFR1YDR085C 1863 nt2.37□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SPE1YKL184W 1401 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YDR193WYDR193W 399 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 CHZ1YER030W 462 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 RNR4YGR180C 1038 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 SYS1YJL004C 612 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 YKL123WYKL123W 381 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 EMC6YLL014W 327 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 ICY1YMR195W 384 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 HAA1YPR008W 2085 nt2.36□□□□□ -2.03
SPC19Q03954 BFA1YJR053W 1725 nt2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.7 ms