Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 SWC7YLR385C 399 nt5.48□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt5.48□□□□□ -1.53
SSP1P38871 PFK26YIL107C 2484 nt5.48□□□□□ -1.53
SSP1P38871 TCP1YDR212W 1680 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YOL075CYOL075C 3885 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YGL217CYGL217C 342 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 DLS1YJL065C 504 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YOR015WYOR015W 360 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YPL062WYPL062W 405 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 YPR146CYPR146C 330 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 SSE1YPL106C 2082 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 TOF2YKR010C 2316 nt5.47□□□□□ -1.53
SSP1P38871 GDE1YPL110C 3672 nt5.46□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RPS27AYKL156W 249 nt5.46□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RPL38YLR325C 237 nt5.46□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RAD16YBR114W 2373 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 PSF1YDR013W 627 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YER121WYER121W 345 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 snR52snR52 92 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 DIS3YOL021C 3006 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 PRR1YKL116C 1557 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 PGM2YMR105C 1710 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 GDB1YPR184W 4611 nt5.45□□□□□ -1.54
SSP1P38871 TFB1YDR311W 1929 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 LCD1YDR499W 2244 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YJL181WYJL181W 1836 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 PUF6YDR496C 1971 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YIL059CYIL059C 366 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RRN6YBL014C 2685 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YRM1YOR172W 2361 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 FAA1YOR317W 2103 nt5.44□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YDR426CYDR426C 378 nt5.43□□□□□ -1.54
SSP1P38871 MSD1YPL104W 1977 nt5.43□□□□□ -1.54
SSP1P38871 BRO1YPL084W 2535 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YNL034WYNL034W 1839 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 MRPL33YMR286W 261 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RPS7AYOR096W 573 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RIM15YFL033C 5313 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YGR266WYGR266W 2106 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 GLT1YDL171C 6438 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 KRE6YPR159W 2163 nt5.42□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YNR042WYNR042W 429 nt5.41□□□□□ -1.54
SSP1P38871 RPL21BYPL079W 483 nt5.41□□□□□ -1.54
SSP1P38871 HDA3YPR179C 1968 nt5.41□□□□□ -1.54
SSP1P38871 YTA6YPL074W 2265 nt5.41□□□□□ -1.54
SSP1P38871 VID27YNL212W 2349 nt5.41□□□□□ -1.54
SSP1P38871 HFM1YGL251C 3564 nt5.4□□□□□ -1.55
SSP1P38871 PDE2YOR360C 1581 nt5.4□□□□□ -1.55
SSP1P38871 ECM5YMR176W 4236 nt5.4□□□□□ -1.55
SSP1P38871 LEU3YLR451W 2661 nt5.4□□□□□ -1.55
SSP1P38871 MDM20YOL076W 2391 nt5.4□□□□□ -1.55
SSP1P38871 PRP42YDR235W 1635 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 RBK1YCR036W 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 GEP4YHR100C 558 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 YLR416CYLR416C 399 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 GOT1YMR292W 417 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 PEX8YGR077C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
SSP1P38871 APC2YLR127C 2562 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 YDL176WYDL176W 2127 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 DOA4YDR069C 2781 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 APC9YLR102C 798 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 SEC5YDR166C 2916 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 CAF130YGR134W 3369 nt5.38□□□□□ -1.55
SSP1P38871 PCA1YBR295W 3651 nt5.37□□□□□ -1.55
SSP1P38871 GCD6YDR211W 2139 nt5.37□□□□□ -1.55
SSP1P38871 MCH4YOL119C 1506 nt5.37□□□□□ -1.55
SSP1P38871 PTA1YAL043C 2358 nt5.36□□□□□ -1.55
SSP1P38871 YOR1YGR281W 4434 nt5.36□□□□□ -1.55
SSP1P38871 CWH43YCR017C 2862 nt5.36□□□□□ -1.55
SSP1P38871 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.36□□□□□ -1.55
SSP1P38871 YPR053CYPR053C 456 nt5.36□□□□□ -1.55
SSP1P38871 GAL10YBR019C 2100 nt5.35□□□□□ -1.55
SSP1P38871 ETP1YHL010C 1758 nt5.35□□□□□ -1.55
SSP1P38871 DNF2YDR093W 4839 nt5.35□□□□□ -1.55
SSP1P38871 VHS3YOR054C 2025 nt5.35□□□□□ -1.55
SSP1P38871 SLM2YNL047C 1971 nt5.35□□□□□ -1.55
SSP1P38871 BLM10YFL007W 6432 nt5.34□□□□□ -1.55
SSP1P38871 TFB5YDR079C-A 219 nt5.34□□□□□ -1.55
SSP1P38871 YHR217CYHR217C 462 nt5.34□□□□□ -1.55
SSP1P38871 snR10snR10 245 nt5.34□□□□□ -1.55
SSP1P38871 VTC4YJL012C 2166 nt5.33□□□□□ -1.56
SSP1P38871 NAG1YGR031C-A 492 nt5.33□□□□□ -1.56
SSP1P38871 SOD1YJR104C 465 nt5.33□□□□□ -1.56
SSP1P38871 KEL2YGR238C 2649 nt5.33□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YML007C-AYML007C-A 111 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YML037CYML037C 1023 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 NHP6AYPR052C 282 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YPR092WYPR092W 306 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 GYL1YMR192W 2163 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 SIP3YNL257C 3690 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 NCL1YBL024W 2055 nt5.32□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YHR210CYHR210C 1026 nt5.31□□□□□ -1.56
SSP1P38871 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.31□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt5.31□□□□□ -1.56
SSP1P38871 UPS1YLR193C 528 nt5.31□□□□□ -1.56
SSP1P38871 snR191snR191 274 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms