Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEST4Q8NFU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms