Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME3Q16798 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ME3Q16798 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms