Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 TRM7YBR061C 933 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 NSL1YPL233W 651 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YKL075CYKL075C 1353 nt2.34□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 LEU3YLR451W 2661 nt2.34□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YGR242WYGR242W 309 nt2.33□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YOL150CYOL150C 312 nt2.33□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 SNF12YNR023W 1701 nt2.33□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 VPS13YLL040C 9435 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YJL070CYJL070C 2667 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 RPS17AYML024W 411 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 OST2YOR103C 393 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 POP7YBR167C 423 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YBR277CYBR277C 402 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 ADF1YCL058W-A 342 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 PRK1YIL095W 2433 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 MSL5YLR116W 1431 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 PTP3YER075C 2787 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 IST2YBR086C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 VAC8YEL013W 1737 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 COA4YLR218C 453 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YLR366WYLR366W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 UBP2YOR124C 3819 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YOR169CYOR169C 465 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 ARR2YPR200C 393 nt2.31□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 PBP4YDL053C 558 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 GPI8YDR331W 1236 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YMR144WYMR144W 1029 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 VTI1YMR197C 654 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YOR050CYOR050C 348 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 RSA1YPL193W 1146 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YCL020WYCL020W 1317 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 TRA1YHR099W 11235 nt2.3□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 PHO91YNR013C 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 STE11YLR362W 2154 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 ECM5YMR176W 4236 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 SEC16YPL085W 6588 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 FMP16YDR070C 282 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YFR056CYFR056C 369 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 NUM1YDR150W 8247 nt2.29□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YNL034WYNL034W 1839 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 SAC3YDR159W 3906 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 MBB1YJL199C 327 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YLR224WYLR224W 1110 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YOR331CYOR331C 558 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 YPL276WYPL276W 438 nt2.28□□□□□ -2.04
NFI1Q12216 RRP6YOR001W 2202 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SSF1YHR066W 1362 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SEC28YIL076W 891 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YBR287WYBR287W 1284 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 MET18YIL128W 3099 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SSE1YPL106C 2082 nt2.27□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 CLN3YAL040C 1743 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 TSA2YDR453C 591 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SDL1YIL167W 633 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 CAP1YKL007W 807 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 PRE8YML092C 753 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SRL4YPL033C 846 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RPN3YER021W 1572 nt2.26□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 ASG1YIL130W 2895 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 KAP123YER110C 3342 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 ATG38YLR211C 681 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 CAT5YOR125C 702 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 PTC5YOR090C 1719 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RTT107YHR154W 3213 nt2.25□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RTT101YJL047C 2529 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 PGD1YGL025C 1194 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YIP1YGR172C 747 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RPS12YOR369C 432 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 Q0255Q0255 1419 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SAP185YJL098W 3177 nt2.24□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SHE4YOR035C 2370 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 UBR1YGR184C 5853 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 NCS2YNL119W 1482 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 snR83snR83 306 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YDR248CYDR248C 582 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YGR226CYGR226C 210 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 GPI14YJR013W 1212 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 AIM32YML050W 936 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YNL179CYNL179C 438 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YNR021WYNR021W 1215 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 ARL3YPL051W 597 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 MSB1YOR188W 3414 nt2.23□□□□□ -2.05
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