Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 TFA2YKR062W 987 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 HUB1YNR032C-A 222 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YGR015CYGR015C 987 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 RPL11BYGR085C 525 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 SSP1YHR184W 1716 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 RPL11AYPR102C 525 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 RED1YLR263W 2484 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 CMC4YMR194C-B 222 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 CAT2YML042W 2013 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 TRS65YGR166W 1683 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 SDC1YDR469W 528 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YBL083CYBL083C 426 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 SNF5YBR289W 2718 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 ARI1YGL157W 1044 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 SPO24YPR036W-A 204 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 EAF1YDR359C 2949 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 VAM6YDL077C 3150 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 MUS81YDR386W 1899 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 TIM11YDR322C-A 291 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YGR149WYGR149W 1299 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 PEP8YJL053W 1140 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 MCR1YKL150W 909 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YOR263CYOR263C 408 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 MSS11YMR164C 2277 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 IRA2YOL081W 9240 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YCL068CYCL068C 783 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 BSC2YDR275W 708 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 APD1YBR151W 951 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YPR148CYPR148C 1308 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 RSR1YGR152C 819 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YNL114CYNL114C 372 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 OST2YOR103C 393 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YIP3YNL044W 531 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 ISA2YPR067W 558 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 SEC59YMR013C 1560 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 SRP1YNL189W 1629 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YOR093CYOR093C 4947 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YGR026WYGR026W 837 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YOR062CYOR062C 807 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 YBR096WYBR096W 693 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 VID24YBR105C 1089 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 STN1YDR082W 1485 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 RIT1YMR283C 1542 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 VPS9YML097C 1356 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-BRQ12193 EMC2YJR088C 879 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 GAL7YBR018C 1101 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 ATP22YDR350C 2055 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 URM1YIL008W 300 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 PLM2YDR501W 1566 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 CSM2YIL132C 642 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 IAH1YOR126C 717 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 HSH49YOR319W 642 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 IRC3YDR332W 2070 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 HMS1YOR032C 1305 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 LEU3YLR451W 2661 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YIL058WYIL058W 285 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YNL234WYNL234W 1281 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 MGE1YOR232W 687 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 USV1YPL230W 1176 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 DXO1YDR370C 1329 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 MPS1YDL028C 2295 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YJL211CYJL211C 444 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YOL114CYOL114C 609 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 TFB1YDR311W 1929 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 RAD9YDR217C 3930 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 RPS26BYER131W 360 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 HRT3YLR097C 1035 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 MTG1YMR097C 1104 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 RIO2YNL207W 1278 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 SET3YKR029C 2256 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YEL028WYEL028W 462 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 CLC1YGR167W 702 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 YUH1YJR099W 711 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 APL3YBL037W 3078 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-BRQ12193 MAL33YBR297W 1407 nt1.09□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 TAH1YCR060W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 CDC36YDL165W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 HTA1YDR225W 399 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SNX4YJL036W 1272 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SFT1YKL006C-A 294 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YLR140WYLR140W 327 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SHE3YBR130C 1278 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 STE24YJR117W 1362 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YER137C-AYER137C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YER159C-AYER159C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YJR026WYJR026W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YJR028WYJR028W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
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