Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC78A2IDD5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms