Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 48.38□□□□□ -1.076e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 DNAJC1-205ENST00000483085 442 ntTSL 38.29□□□□□ -1.086e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.126e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TJP2-203ENST00000377259 588 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.136e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 47.62□□□□□ -1.196e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ACACA-246ENST00000621960 551 ntTSL 57.6□□□□□ -1.196e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.246e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIGK-204ENST00000478391 737 ntTSL 27.16□□□□□ -1.266e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.276e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)7.08□□□□□ -1.286e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.36e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.36e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SIAH1-204ENST00000563745 589 ntTSL 46.92□□□□□ -1.36e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.62□□□□□ -1.356e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.386e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.46e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.456e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.496e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.66e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ELOVL6-203ENST00000503885 458 ntTSL 44.74□□□□□ -1.656e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.666e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 54.62□□□□□ -1.676e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TGFBR1-204ENST00000547314 533 ntTSL 44.49□□□□□ -1.696e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.726e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 34.19□□□□□ -1.746e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.786e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 53.92□□□□□ -1.786e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 53.89□□□□□ -1.796e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ELOVL6-208ENST00000514184 607 ntTSL 33.72□□□□□ -1.816e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 33.63□□□□□ -1.836e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 53.2□□□□□ -1.96e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 23.15□□□□□ -1.916e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 23.11□□□□□ -1.916e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.916e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 33.09□□□□□ -1.916e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.936e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.52□□□□□ -2.016e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TGFBR1-210ENST00000552573 526 ntTSL 41.61□□□□□ -2.156e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-201ENST00000265601 904 ntTSL 518.71■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-210ENST00000447287 652 ntTSL 318.71■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-209ENST00000444391 898 ntTSL 516.66■□□□□ 0.266e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 415.95■□□□□ 0.146e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 415.83■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -06e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.036e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.076e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.326e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.656e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-208ENST00000419252 740 ntTSL 310.89□□□□□ -0.676e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-203ENST00000368938 678 ntTSL 49.88□□□□□ -0.836e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 WASF1-204ENST00000392586 2815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.896e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-213ENST00000448449 1055 ntTSL 55.93□□□□□ -1.466e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 ST6GAL1-209ENST00000442023 570 ntTSL 44.67□□□□□ -1.666e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 BACH1-205ENST00000447177 751 ntTSL 210.66□□□□□ -0.77e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-205ENST00000586531 898 ntTSL 321.52■■□□□ 1.045e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SFT2D2-203ENST00000471981 666 ntTSL 519.71■□□□□ 0.756e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PARD3B-205ENST00000415947 1668 ntTSL 1 (best)19.58■□□□□ 0.726e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 218.46■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-205ENST00000415298 2515 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.546e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 317.62■□□□□ 0.415e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 517.25■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 416.74■□□□□ 0.275e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 516.66■□□□□ 0.266e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.146e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.16e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.026e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.16e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-207ENST00000444408 561 ntTSL 413.82□□□□□ -0.26e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.256e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.356e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC12-209ENST00000441099 698 ntTSL 312.67□□□□□ -0.386e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 312.45□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.566e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.586e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 411.22□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 EP400-209ENST00000616136 3134 ntTSL 211.13□□□□□ -0.636e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.686e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 510.46□□□□□ -0.736e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 EP400-201ENST00000330386 3908 ntTSL 210.42□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 XPO6-207ENST00000565284 662 ntTSL 210.21□□□□□ -0.776e-6■■■■□ 22.2
EXOSC5Q9NQT4 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.796e-6■■■■□ 22.2
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 210.6 ms