Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP13Q86W25 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP13Q86W25 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP13Q86W25 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms