Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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