Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 HHF2YNL030W 312 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YPR197CYPR197C 564 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 ROG1YGL144C 2058 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RGC1YPR115W 3252 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YJL132WYJL132W 2253 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 CHS3YBR023C 3498 nt3.02□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 SCY1YGL083W 2415 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 TCP1YDR212W 1680 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 TIF4631YGR162W 2859 nt3.02□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 SNA4YDL123W 423 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 EMI1YDR512C 564 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 USE1YGL098W 738 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 OST6YML019W 999 nt3.02□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 RSM19YNR037C 276 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YPL185WYPL185W 396 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YBR259WYBR259W 2067 nt3.02□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SSF1YHR066W 1362 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 RIM13YMR154C 2184 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YDR061WYDR061W 1620 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 BMH2YDR099W 822 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 GPI19YDR437W 423 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 RPL23BYER117W 414 nt3.01□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 DLS1YJL065C 504 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YKL066WYKL066W 444 nt3.01□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR209WYBR209W 318 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 KAR9YPL269W 1935 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 IOC3YFR013W 2364 nt3.01□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 DBP10YDL031W 2988 nt3□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 MPS1YDL028C 2295 nt3□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 CDC55YGL190C 1581 nt3□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 HFM1YGL251C 3564 nt3□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 VEL1YGL258W 621 nt3□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SKP2YNL311C 2292 nt3□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 GIS4YML006C 2325 nt2.99□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 BI4Q0120 1917 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 UTP15YMR093W 1542 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 MUS81YDR386W 1899 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 EMP70YLR083C 2004 nt2.99□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHL005CYHL005C 393 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 PEP8YJL053W 1140 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 HIT1YJR055W 495 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YMR141CYMR141C 309 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 RPL16BYNL069C 597 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YBR062CYBR062C 543 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 TFC1YBR123C 1950 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 VPS3YDR495C 3036 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 FRE8YLR047C 2061 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SSF2YDR312W 1362 nt2.99□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 HBT1YDL223C 3141 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YCG1YDR325W 3108 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YDL009CYDL009C 324 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 RPL40BYKR094C 387 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SFM1YOR021C 642 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YOR392WYOR392W 444 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 FMP23YBR047W 528 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 NTC20YBR188C 423 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 STT4YLR305C 5703 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SPE1YKL184W 1401 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 GYL1YMR192W 2163 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YNL193WYNL193W 1677 nt2.98□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SPO14YKR031C 5052 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SPO71YDR104C 3738 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 EAP1YKL204W 1899 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 SPC1YJR010C-A 285 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 BET3YKR068C 582 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 COX14YML129C 213 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 ADI1YMR009W 540 nt2.97□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 PFY1YOR122C 381 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 IRC16YPR038W 360 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 ARR2YPR200C 393 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 ILS1YBL076C 3219 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 DOA4YDR069C 2781 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 GDI1YER136W 1356 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 YIL169CYIL169C 2988 nt2.97□□□□□ -1.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 YRR1YOR162C 2433 nt2.97□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 CBP2YHL038C 1893 nt2.96□□□□□ -1.93
PUF2Q12221 ENA5YDR038C 3276 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 CSR2YPR030W 3366 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 DBF20YPR111W 1695 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MAK21YDR060W 3078 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RTR2YDR066C 591 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPB9YGL070C 369 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 CRG1YHR209W 876 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 NOP15YNL110C 663 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MRPL40YPL173W 894 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 GCD6YDR211W 2139 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MNT3YIL014W 1893 nt2.96□□□□□ -1.94
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