Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 YLR053CYLR053C 327 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 EGD1YPL037C 474 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 NTC20YBR188C 423 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 BBC1YJL020C 3474 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 DNM1YLL001W 2274 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 GMC1YDR506C 1827 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YDR250CYDR250C 276 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 IGO2YHR132W-A 396 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 MRPL39YML009C 213 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 CYB5YNL111C 363 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 ULP1YPL020C 1866 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YPL025CYPL025C 558 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 ELM1YKL048C 1923 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 AIP1YMR092C 1848 nt4.93□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 PBS2YJL128C 2007 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 DPB11YJL090C 2295 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 ARF1YDL192W 546 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 PEX11YOL147C 711 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 LTP1YPR073C 486 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SSP1YHR184W 1716 nt4.92□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SEC39YLR440C 2130 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SBE2YDR351W 2595 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 PIN4YBL051C 2007 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 CUL3YGR003W 2235 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 RIP1YEL024W 648 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YHR078WYHR078W 1659 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SOK2YMR016C 2358 nt4.91□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 RPS22BYLR367W 393 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 MET12YPL023C 1974 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 NAN1YPL126W 2691 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 LRE1YCL051W 1752 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 VPS41YDR080W 2979 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 KAR2YJL034W 2049 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 TRS85YDR108W 2097 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 PXA1YPL147W 2613 nt4.9□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 ALR2YFL050C 2577 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 AUA1YFL010W-A 285 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 RFC3YNL290W 1023 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 snR17bsnR17b 332 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 SEC9YGR009C 1956 nt4.89□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 REB1YBR049C 2433 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 MSH4YFL003C 2637 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 BEM4YPL161C 1902 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 NAM2YLR382C 2685 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 MIP6YHR015W 1980 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 LHP1YDL051W 828 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YJL206CYJL206C 2277 nt4.88□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 PAN1YIR006C 4443 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 OPT2YPR194C 2634 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 ATP15YPL271W 189 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 REV1YOR346W 2958 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 NHX1YDR456W 1902 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 SWI3YJL176C 2478 nt4.87□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 PSE1YMR308C 3270 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 DAL81YIR023W 2913 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 RPS24AYER074W 408 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 TIM8YJR135W-A 264 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YKR033CYKR033C 426 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 ATP25YMR098C 1839 nt4.86□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 APC4YDR118W 1959 nt4.85□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 PHO2YDL106C 1680 nt4.85□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 GAC1YOR178C 2382 nt4.85□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 VIP1YLR410W 3441 nt4.85□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 SRP68YPL243W 1800 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 RPS23AYGR118W 438 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 NUP116YMR047C 3342 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 TPS3YMR261C 3165 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 GAL4YPL248C 2646 nt4.84□□□□□ -1.63
YRR1Q12172 MES1YGR264C 2256 nt4.84□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YBR259WYBR259W 2067 nt4.84□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YHR217CYHR217C 462 nt4.83□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 SSB2YNL209W 1842 nt4.83□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YMR196WYMR196W 3267 nt4.83□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 AIM9YER080W 1884 nt4.82□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 UBP12YJL197W 3765 nt4.82□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 STE20YHL007C 2820 nt4.82□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YGR269WYGR269W 327 nt4.81□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.81□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YLL007CYLL007C 1998 nt4.81□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 KRE6YPR159W 2163 nt4.81□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 DAP2YHR028C 2457 nt4.81□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 ROK1YGL171W 1695 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 CCT7YJL111W 1653 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 TFB5YDR079C-A 219 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 SNU13YEL026W 381 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YPL182CYPL182C 384 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 TRM7YBR061C 933 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 YBR224WYBR224W 516 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 PEX5YDR244W 1839 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 FAA3YIL009W 2085 nt4.8□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 BIT61YJL058C 1632 nt4.79□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 PDS5YMR076C 3834 nt4.79□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 HFA1YMR207C 6372 nt4.79□□□□□ -1.64
YRR1Q12172 CYM1YDR430C 2970 nt4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 114.6 ms