Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMCO3A2RU48 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms