Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEFF2Q9UIK5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms