Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms