Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC181Q5TID7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms