Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YPR096CYPR096C 303 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPC40YPR110C 1008 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YPR197CYPR197C 564 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YBR285WYBR285W 435 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPA135YPR010C 3612 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 VAS1YGR094W 3315 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 BMH2YDR099W 822 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PHD1YKL043W 1101 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 ECM4YKR076W 1113 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RIM9YMR063W 720 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RIO2YNL207W 1278 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 FMP23YBR047W 528 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 UBP5YER144C 2418 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 DOA4YDR069C 2781 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YCG1YDR325W 3108 nt3.14□□□□□ -1.91
HER1Q12276 APC5YOR249C 2058 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PAM1YDR251W 2493 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RED1YLR263W 2484 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YDR537CYDR537C 606 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 BIG1YHR101C 1008 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPL6BYLR448W 531 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PBS2YJL128C 2007 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 MNT3YIL014W 1893 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 TOM70YNL121C 1854 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 MSR1YHR091C 1932 nt3.13□□□□□ -1.91
HER1Q12276 GYL1YMR192W 2163 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RAD2YGR258C 3096 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 HAA1YPR008W 2085 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SHS1YDL225W 1656 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YDR250CYDR250C 276 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 ERV1YGR029W 570 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 AGE2YIL044C 897 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPL40BYKR094C 387 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PDP3YLR455W 915 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPS16AYMR143W 432 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YBR062CYBR062C 543 nt3.12□□□□□ -1.91
HER1Q12276 CHS2YBR038W 2892 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 GPI19YDR437W 423 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YER181CYER181C 324 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 MTC3YGL226W 372 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YIL141WYIL141W 390 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YJL086CYJL086C 369 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPS1AYLR441C 768 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 ATX1YNL259C 222 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SWM2YNR004W 441 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YOR392WYOR392W 444 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SSE2YBR169C 2082 nt3.11□□□□□ -1.91
HER1Q12276 IRC3YDR332W 2070 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 BRE5YNR051C 1548 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 DUF1YOL087C 3351 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SRD1YCR018C 666 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PAU10YDR542W 363 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SMX2YFL017W-A 234 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PAU11YGL261C 363 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YGR017WYGR017W 894 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 HIT1YJR055W 495 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 BET3YKR068C 582 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YLR076CYLR076C 423 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PAU4YLR461W 363 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 MRPL40YPL173W 894 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 snR35snR35 204 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RRI2YOL117W 1938 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 BEM4YPL161C 1902 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 EXO84YBR102C 2262 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 STT4YLR305C 5703 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 DIA2YOR080W 2199 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.1□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PEX6YNL329C 3093 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 FAR1YJL157C 2493 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 AHC2YCR082W 387 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 MIC19YFR011C 513 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPL11BYGR085C 525 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SPC1YJR010C-A 285 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YKL066WYKL066W 444 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RFC3YNL290W 1023 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YBR051WYBR051W 351 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPL11AYPR102C 525 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 STI1YOR027W 1770 nt3.09□□□□□ -1.91
HER1Q12276 CDC55YGL190C 1581 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 ARO1YDR127W 4767 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 TIF4631YGR162W 2859 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 MUS81YDR386W 1899 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 IRC2YDR112W 309 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 YGL015CYGL015C 393 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 RPL15AYLR029C 615 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 YBL065WYBL065W 345 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 IMP4YNL075W 873 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 LTP1YPR073C 486 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 MPS1YDL028C 2295 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 YDL180WYDL180W 1644 nt3.08□□□□□ -1.92
HER1Q12276 BNI4YNL233W 2679 nt3.07□□□□□ -1.92
HER1Q12276 REC8YPR007C 2043 nt3.07□□□□□ -1.92
HER1Q12276 ROM1YGR070W 3468 nt3.07□□□□□ -1.92
HER1Q12276 RTT105YER104W 627 nt3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms