Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms