Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms