Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.9 ms